A l'escola, en Nobita i els seus amics han de fer un treball sobre el mar. Com que en Nobita no és precisament un estudiant modèlic, convenç en Doraemon per portar a terme una aventura real, més enllà dels llibres de text, i salpen a la recerca d’un tresor perdut.
Un fenomen estrany i inesperat els transporta fins al segle XVII, on hauran d’enfrontar-se a autèntics pirates i perillosos monstres marins.
